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Errata for Foundations of Systems Biology

Errata for Foundations of Systems Biology : Using Cell Illustrator and Pathway Databases

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Last updated 3/4/10.

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Page 35, fifth row in each subtable in Table 4.1.

Change continuous to generic.

Page 59, third line from bottom.

Change (nucleoplasmic p53, process, cytoplasmic 53) to (nucleoplasmic p53, cytoplasmic 53, process).

Page 69, second line from bottom.

Change from 2 to 5 to from 1 to 5.

Page 118, third line.

Change "the upstream sites of" to "the upstream of".

A textbook for Cell Illustrator

  • Masao Nagasaki, Ayumu Saito, Atsushi Doi, Hiroshi Matsuno, Satoru Miyano

Foundations of Systems Biology : Using Cell Illustrator and Pathway Databases (Springer)

Errata

Textbook for Cell Illustrator in Japanese

  • 土井淳・長崎正朗・斉藤あゆむ・松野浩嗣・宮野悟 著

システム生物学がわかる！ －セルイラストレータを使ってみよう－ (共立出版)

付属 CD-ROM の Cell Illustrator 簡易版を使用しながら、システム生物学の実践的基礎を学べる入門書です。

Cell Illustrator (簡易版) が起動できない場合の解決方法のご案内

付属の CD-ROM の Cell Illustrator (簡易版) をインストールした後に、Cell Illustrator を起動しようとすると「Invalid License」 というダイアログが表示され、 Cell Illustrator が起動できないことがあります (下図)。

原因

これは、 Java 1.6 系がインストールされている Windows で起こることがあります。インストールの最中に、Cell Illustrator を起動に必要な "license.txt" というファイルの内容が変わってしまうために起こります。

解決方法

以下のいずれかの方法で解決できます。よくわからない場合は、フォーラム をご利用ください。

解決方法 1: license.txt を手動で正しいものに置き換える方法
  1. license.txt をダウンロードしてください (右クリック → [名前を付けて保存] など)。
  2. Cell Illustrator がインストールされているフォルダに上書きコピーしてください。

Cell Illustrator がインストールされている標準的なフォルダは、 

C:\Program Files\GNI\Cell Illustrator 3.0

です。

解決方法 2: Java をアンインストールしてから Cell Illustrator をインストールする方法
  1. パソコンにインストールされている Java をアンインストールします。
  2. CD-ROM に収録されている Java 付きの Cell Illustrator のインストーラでインストールします。
CI30Setup\Windows\CI3.0_wj_setup.exe

(CI3.0_setup.exe ではありません)

Cell Illustrator のインストール後に再び Java をインストールしても、支障はありません。

解決方法 3: 専用のライセンス修正プログラムを実行する方法
  1. 「Invalid License」 のダイアログが表示されている場合は閉じてください。
  2. UpdateCIBook.exe をダウンロードして実行してください。
  3. 修正するべきファイルを自動的に探すために「SEARCH」ボタンを押してください。
  4. 修正できるファイルが見つかったら「UPDATE」ボタンを押してください。
  5. 修正が完了したら「Exit」ボタンを押してください。

※ 順当にいかない場合は、プログラムが表示するメッセージを参考に操作してください。